产品介绍:
SnapGene 是一个直观允许用户分析和修改 DNA图谱的应用程序,并将它们导出到其他 fomats.由于这个软件,分子生物学家有可能使,探索或共享共享详细的 DNA 序列文件.
产品功能:
1.可视化
DNA可视化
查看DNA序列的多个视图。
地图 · 序列 · 酶 · 特征 · 引物 · 历史
自定义酶位点,特征,引物,ORF,DNA颜色等的显示。地图可以是圆形或线性格式。
查看 · 搜索 · 缩放
利用SnapGene的高效数据处理功能,扫描具有数千种注释功能的大型DNA序列。
查看蛋白质序列的多个视图。
地图 · 序列 · 属性 · 特征 · 历史
自定义区域,站点,键和序列颜色的显示。
轻松编辑DNA和蛋白质序列。
标准编辑 · DNA结束
进行插入,删除,替换和大小写更改。复制并粘贴序列时,会自动传输功能。
将选定的DNA或氨基酸序列设置为十种颜色之一。
给两条DNA链或蛋白质序列着色。颜色在Map和Sequence视图中都可见。
自动注释常用功能,或手动注释新功能。
自动特征检测 · 手动特征注释
使用SnapGene广泛的数据库查找DNA序列中的常见特征。您选择的其他功能可以添加到自定义数据库中。
2.模拟
确认限制性网站适合克隆。
独特性 · 甲基化敏感性 · 特殊性质
以粗体显示独特的限制性位点,或选择自动定义的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶组。
可视化克隆过程的所有方面。
如果您已经考虑过程,则模拟只需几秒钟。如果克隆过程存在设计缺陷,则可以捕获并纠正错误。
模拟标准PCR。
使用您自己的引物,或要求SnapGene自动设计引物。产品文件在其历史记录中存储模板和引物。
通过重叠延伸PCR融合片段。
多可组装八个片段。选择要连接的片段及其方向,SnapGene将设计引物。
使用诱变引物进行定点诱变。
选择诱变引物,按下按钮查看修饰的质粒。历史颜色突出了突变。
模拟网关® BP克隆或LR克隆,或两者在同一时间。
为方便起见,提供了常见的供体向量和目的向量。选择要组装的片段,SnapGene将设计引物。
通过融合多达八个片段或通过将多达八个片段插入向量来模拟Gibson Assembly。Gibson Assembly是一种流行的无缝克隆方法。
选择要融合的片段及其方向,SnapGene将设计引物。线性化的载体可以通过酶消化或反向PCR产生。
通过在向量中插入 多八个片段来模拟Clontech的In-Fusion克隆。In-Fusion克隆是一种非常通用的方法,可用于创建无缝基因融合。
选择要融合的片段及其方向,SnapGene将设计引物。线性化的载体可以通过酶消化或反向PCR产生。
通过TA或GC克隆捕获PCR产物。
选择传统的TA克隆或高效GC克隆。
为方便起见,提供了常见的TA克隆载体和Lucigen的GC克隆载体。
退火两个寡核苷酸形成双链产物。使用简单的控件添加突出限制克隆
3.规避错误
阅读基因融合的框架
确保构造中的已转换要素符合框架。使用“序列”视图可以快速查看两个已翻译的要素是否在框架中。如果是这样,翻译链接在同一行。如果不是,则翻译在单独的行上。
与参考序列对齐
使用强大的对齐工具检查实际构造是否与模拟构造匹配。
4.自动录制
全面的“撤销”能力
几乎撤消任何操作。不要害怕尝试使用SnapGene文件 - 回溯您的步骤很容易。
历史和嵌入式祖先
查看构造的图形历史记录。单击操作以突出显示亲本和产物序列的相关部分,或单击PCR引物名称以查看引物序列。
单击历史记录树中的祖先以重新生成该祖先序列文件,包括其注释和克隆历史记录。
历史色彩
使用可选的历史记录颜色来标识序列的 新更改。
5.数据
安全文件管理
将SnapGene文件保存在所需的位置。使用熟悉的安全操作系统来存储和整理SnapGene文件。
从其他格式导入
阅读许多常见的文件格式。不仅可以导入DNA序列,还可以导入注释和注释。我们将继续开发进口商,以确保您不会被锁定为专有文件格式。
导出为标准格式
将序列,地图或凝胶图像转换为标准格式,以便与其他软件一起使用。将序列导出为GenBank或FASTA格式。将地图或模拟琼脂糖凝胶导出为常见的图像格式。
使用SnapGene Viewer共享数据
将SnapGene格式的文件发送给可以下载免费SnapGene Viewer的同事或客户。只需将文件与链接一起发送到SnapGene Viewer即可。收件人将能够看到地图,序列和注释,就像在完整的SnapGene界面中一样。
6.转换文件格式
开放式信息交换至关重要,因此SnapGene和SnapGene Viewer提供了读取和导出常见文件格式的选项。
从其他格式导入时,目标不仅是捕获DNA序列,还捕获注释和注释。